snapgene(dna序列分析工具)
2 ene 文件 on 引物设计 文件格式 in strong 模拟 gen
- 支 持:Windows操作系统
- 分 类:软件下载
- 大 小:48.07MB
- 开发者:王者五强
- 提 现:634
- 说 明:v5.2.4 绿色版
- 下载量:次
- 发 布:2024-09-07 08:24:01
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#snapgene(dna序列分析工具)简介
snapgene汉化版是一款功能齐全的dna编码序列分析工具,有着友善的操作界面,可以便捷,全方位地纪录大家常常转化成的全部构造,用以仿真模拟各种各样普遍的复制和PCR方式,节约了大批量的时长和钱财,非常容易使用的交互和仿真模拟,提早预测分析很有可能造成的不正确,致力于为客户带来健全的方案,交互和纪录您的日常生物学程序流程的解决方法。此软件肯定可以替代你手里的纸和笔,可产生无以伦比的操控感受,你能十分生动有趣的开展视频语音和DNA图剖析,并可以根据.dna文件与朋友分享丰富多彩的带注解的地形图和编码序列,有兴趣的客户可以在这儿在线下载感受。
snapgene精简版APP详细介绍:
一、想像
1、DNA交互
查询DNA序列的好几个主视图。
地形图 · 编码序列 · 酶 · 特点 · 引物设计 · 历史时间
自定酶结构域,特点,引物设计,ORF,DNA色调等的表明。地形图可以是环形或线形文件格式。
应用发夹结构方式查询酶结构域,具备翻译工作,引物设计和DNA色调的特点。多肽链方式表明具备五颜六色特点的紧密概述。
从一系列酶组里挑选。剪截网址可以表明为数据或行,按名字或工作频率排列。
按名字,部位,尺寸,色调,专一性或种类对带注解的因素目录开展排列。勾选框在紧密或彻底进行的表明中间转换。
按名字,长短,色调,融合结构域,专一性或解链溫度对混种杂交引物设计目录开展排列。勾选框在紧密或彻底进行的表明中间转换。
查询DNA搭建体的自动生成的图型历史数据。先祖编码序列可以做为独立的文件找回
2、大编码序列适用
访问性染色体尺寸编码序列。
查询 · 检索 · 调整图片大小
运用SnapGene的高效率数据处理方法作用,扫描仪具备数千种注解作用的大中型DNA序列。
应用专用的MICA优化算法马上在性染色体内寻找编码序列。
应用多用途控制调节调整图片大小指数和表明地区。
3、蛋白交互
查询蛋白编码序列的好几个主视图。
地形图 · 编码序列 · 特性 · 特点 · 历史时间
自定地区,网站,键和编码序列色调的表明。
应用具备有关特点的1-或3个英文字母的碳水化合物编码查询蛋白编码序列。
查询蛋白的相对分子质量,消光系数,等电点和碳水化合物构成。可以对蛋白的选中一部分开展同样的剖析。
按名字,部位,尺寸,色调或种类对带注解的模块代码开展排列。勾选框在紧密或彻底进行的表明中间转换。
查询自动生成的蛋白编码序列图型历史数据。先祖蛋白或DNA序列可以做为独立的文档再造。
4、形象化的编码序列编缉
轻轻松松编缉DNA和蛋白编码序列。
规范编缉 · DNA完毕
开展插进,删掉,更换和大小写字母变更。拷贝并黏贴编码序列时,会全自动传送作用。
编缉线形DNA序列的尾端以加上或除去突出端或磷酸酯。
5、编码序列颜色编码
将选中的DNA或氨基酸序列设定为十种色调之一。
给两根DNA链或蛋白编码序列上色。色调在Map和Sequence主视图里都由此可见。
6、特点注解
全自动注解常用功能,或手动式注解新作用。
全自动特点检验 · 手动式特点注解
应用SnapGene普遍的数据搜索DNA序列中的普遍特点。您挑选的别的作用可以增加到自定数据库查询中。
挑选DNA或蛋白编码序列的一部分,并应用灵巧的GenBank兼容控制注解特点。
二、仿真模拟
1、约束性网站指标值
确定约束性网址合适复制。
特有性 · 甲基化敏感度 · 独特特性
以粗字体表明与众不同的约束性结构域,或挑选全自动界定的Unique Cutters或Unique 6 Cutters酶组。
不必被忽悠,由于约束性结构域被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻隔。SnapGene将全自动用星号标识该网站。
运用专用工具提醒来防止出现问题的限定网址。
2、约束性复制
交互复制全过程的任何层面。
假如您早已考虑到全过程,则仿真模拟只需几秒。假如复制全过程存有设计方案缺点,则可以捕获并改正错误。
3、PCR
仿真模拟规范PCR。
应用您自身的引物设计,或规定SnapGene全自动设计方案引物设计。商品文档在其历史数据中储存模版和引物设计。
4、重合拓宽PCR
根据重合拓宽PCR结合精彩片段
较多可拼装八个残片。挑选要联接的精彩片段以及方位,SnapGene将设计方案引物设计。
5、引物设计定向诱变
应用诱变引物设计开展定点诱变。
挑选诱变引物设计,按下按钮查询装饰的质粒。历史时间色调突显了基因突变。
6、网关ip®复制
仿真模拟网关ip® BP复制或LR复制,或二者在同一时间。
为便捷考虑,给予了普遍的供者空间向量和目地空间向量。挑选要拼装的精彩片段,SnapGene将设计方案引物设计。
7、吉布森交流会®
根据结合高达八个精彩片段或根据将高达八个精彩片段插进空间向量来仿真模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种主流的无缝拼接复制方式。
挑选要结合的精彩片段以及方位,SnapGene将设计方案引物设计。归一化处理的媒介可以根据酶消化吸收或反方向PCR造成。
8、IN-FUSION ®复制
根据在空间向量中插进较多八个精彩片段来仿真模拟Clontech的In-Fusion复制。In-Fusion复制是一种十分通用性的方式,可用以建立无缝拼接dna结合。
挑选要结合的精彩片段以及方位,SnapGene将设计方案引物设计。归一化处理的媒介可以根据酶消化吸收或反方向PCR造成。
9、TA和GC复制
根据TA或GC复制捕获PCR物质。
挑选传统式的TA复制或高效率GC复制。
为便捷考虑,给予了普遍的TA复制媒介和Lucigen的GC复制媒介。
10、淬火Oligos
淬火2个寡核苷酸产生发夹结构物质。
应用单一的控制加上突显限定复制。
三、防止不正确
应用SnapGene,保证结构合乎您的规定,并确定您得到了需要的编码序列。
1、阅读文章dna结合的架构
保证结构中的已变换因素合乎架构。
连接翻译工作 · 提醒信息内容
应用“编码序列”主视图可以迅速查询2个已翻译工作的因素是不是在架构中。如果是这样,翻译工作连接在同一行。要不是,则翻译工作在独立的行上。
2、与参照编码序列两端对齐
应用强劲的两端对齐专用工具查验具体结构是不是与仿真模拟结构配对。
地形图简述 · 编码序列详细资料
客户程序两端对齐编码序列与参照编码序列配对的部位的简述,及其存有差别的部位。
四、全自动视频录制
SnapGene自动保存实际操作以建立图型历史数据,并将先祖构造储存在最后文档中。
1、全方位的“撤消”工作能力
几乎注销一切实际操作。
不要害怕试着应用SnapGene文档 - 回朔您的方法非常容易。
2、历史时间和内嵌式先祖
查询结构的图型历史数据。
点击实际操作以突显亲本和物质编码序列的有关一部分,或点击PCR引物设计名字以查询引物设计编码序列。
点击历史数据树中的先祖以再次转化成该先祖编码序列文档,包含其注解和复制历史数据。
3、历史时间颜色
应用可选择的历史数据色调来标志编码序列的全新变更。
了解搭建体的拼装方法,包含结扎手术的粘性末端。
五、拥有你的数据信息
SnapGene容许您依据必须学习和共享文档,与此同时维持对数据信息的良好控制。
1、安全性文档管理
将SnapGene文档储存在需要的部位。
应用了解的安全可靠电脑操作系统来储存和梳理SnapGene文档。
2、从别的文件格式导进
阅读文章很多普遍的格式文件。
不但可以导进DNA序列,还能够导进注解和注解。大家将持续开发设计采购商,以确保您不容易被定位为专用格式文件。
3、导出来为规范文件格式
将编码序列,地形图或疑胶图象变换为规范文件格式,便于与第三方软件一起应用。
将编码序列导出来为GenBank或FASTA文件格式。将地形图或仿真模拟琼脂糖电泳导出来为普遍的图像文件格式。
4、应用SnapGene Viewer分享数据信息
将SnapGene文件格式的文档发给可以下载免费SnapGene Viewer的朋友或顾客。
只需将文档与连接一起发送至SnapGene Viewer就可以。收货人将可以见到地形图,编码序列和注解,如同在详细的SnapGene页面中一样。
5、针对开发者
要将SnapGene融合到您的数据统计分析或试验室管理系统软件中,请在线留言以获得相关怎样载入和载入SnapGene文档的信息内容。
六、变换格式文件
敞开式信息交换尤为重要,因而SnapGene和SnapGene Viewer给予了载入和导出来普遍格式文件的选择项。
从别的文件格式导进时,总体目标不但是捕获DNA序列,还捕获注解和注解
新功能介绍
1、重叠群交流会
线形或环形重叠群可以从重合编码序列或Sanger编码序列迹线再次拼装。
2、灵便的两端对齐
现在可以以多种方法导进要两端对齐的编码序列。可以获取好几个两端对齐的一部分以转化成新的多种两端对齐,或是可以编缉目前的好几个两端对齐以加上或清除由不一样优化算法转化成的两端对齐。
3、Nicking Enzymes
可以表明NickingDna内切酶。当挑选超越从线形编码序列的尾端到创口Dna内切酶结构域时,可以采用按Delete删掉该多肽链地区。
4、点特点
如今,DNA序列适用零长短点作用,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导进文档时鉴别。
5、酶网址突显
常见的酶结构域可以用关键突显,便于迅速鉴别。
6、融洽一致性提高
多种核对的的共识编码序列具备改善的文件格式,现在可以拷贝或导出来。
7、用以与参照编码序列两端对齐的储存编缉
依据受欢迎的要求,当根据调节核对编码序列的节点编缉与参照DNA序列的核对时,保存和修复这些编缉。
8、从别的格式文件导进作用
可以将特点导到BED,GFF3或GTF文件格式的DNA序列中。
9、从UniProt导进
可以从UniProt数据库查询导进蛋白编码序列纪录。
10、进口的基因c语言编译器新项目
现在可以在SnapGene中立即开启Genome Compiler新项目文档(.gcproj)。针对工程施工新项目文档,在“历史数据”主视图中捕获工程施工历史时间。
11、引物设计加上日期
将引物设计加上到文档时,会纪录日期。引物设计可按加上日期排列。
12、载入和载入两端对齐格式文件
SnapGene可以将两端对齐导进SAM / BAM和VectorNTI®.cep文件格式的参照编码序列,并可以将两端对齐导出来为SAM / BAM文件格式的参照编码序列。
snapgene精简版APP优点:
一、为学员,博士研究生和专业技术人员产生的益处
1、工作中更快,更聪慧
APP使您的 DNA 实际操作便于数据可视化和仿真模拟,并在不正确产生以前友情提示。
2、维持纪录不费吹灰之力
APP中的每一个 DNA 实际操作都是会自动保存,因而您可以精确地看见您所做的实际操作并查找先祖构造的编码序列。
3、随时学习培训
假如您不了解复制或特殊技术性,丰富多彩更直观的软件界面可协助您掌握其原理。
4、轻轻松松与全世界的朋友分享数据信息
APP 的 .dna 文档可以根据完全免费的混合开发开启,使您可以与朋友分享丰富多彩的带注解的地形图和编码序列。
二、PI 和试验室管理工具的益处
1、迅速地得到結果
试验室中的工作人员将不会应用有缺陷的复制程序流程浪费时间,错过良好的机会哦!,并将在第一时间逐渐得到合理的结构。
2、花更少的時间教大家怎样复制
APP是一个非常好的学习工具,乃至初学者克隆技术也会迅速掌握怎样自身解决困难。
snapgene精简版APP特点:
1、重叠群交流会
线形或环形重叠群可以从重合编码序列或Sanger编码序列迹线再次拼装。
2、灵便的两端对齐
现在可以以多种方法导进要两端对齐的编码序列。可以获取好几个两端对齐的一部分以转化成新的多种两端对齐,或是可以编缉目前的好几个两端对齐以加上或清除由不一样优化算法转化成的两端对齐。
3、Nicking Enzymes
可以表明NickingDna内切酶。当挑选超越从线形编码序列的尾端到创口Dna内切酶结构域时,可以采用按Delete删掉该多肽链地区。
4、点特点
如今,DNA序列适用零长短点作用,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导进文档时鉴别。
5、酶网址突显
常见的酶结构域可以用关键突显,便于迅速鉴别。
6、融洽一致性提高
多种核对的的共识编码序列具备改善的文件格式,现在可以拷贝或导出来。
7、用以与参照编码序列两端对齐的储存编缉
依据受欢迎的要求,当根据调节核对编码序列的节点编缉与参照DNA序列的核对时,保存和修复这些编缉。
8、从别的格式文件导进作用
可以将特点导到BED,GFF3或GTF文件格式的DNA序列中。
9、从UniProt导进
可以从UniProt数据库查询导进蛋白编码序列纪录。
snapgene精简版应用协助:
一、调节配备
1、开启SnapGene设定文档
SnapGene设定文档坐落于:
ios系统:
〜/库/首选项/ com.gslbiotech.snapgene.plist
窗口:
C:\ Users \登录名\ AppData \数据漫游\ GSLBiotech \ SnapGene.ini
Linux的:
〜/ .snapgene /的Settings.ini
2、禁止使用系统更新
要删掉全部“查验升级”菜单栏选择项并禁止使用自动升级,请在“升级”类型里将“禁止使用”设定为“true”。
3、迁移源作用
要保证在复制时将“源”作用传送到商品,请在“文档”类型里将“transferSourceFeatures”设定为“true”。
二、表明或掩藏酶
1、表明酶
要表明酶,请单击Enzymes → Show Enzymes。
2、掩藏酶
要掩藏酶,请单击酶→掩藏酶。
3、应用侧菜单栏转换酶由此可见性
点击侧菜单栏中的“表明酶”按键也可用来在表明和掩藏全部酶中间转换。
三、挑选一套酶套服
Map和Sequence主视图中展示的酶可以从预订义或订制酶组目录中挑选。
1、挑选一套酶套服
要挑选酶组,请单击酶→应用酶组→[...]。
2、应用侧菜单栏挑选酶组
或是,根据点击侧菜单栏中的“ 表明酶 ”(约束性结构域标志)菜单栏按键来挑选酶组。
四、手动式挑选酶
根据名字或编缉目前酶组或应用检索标准手动式挑选酶。
1、挑选一套酶套服
要挑选目前酶组,请单击酶→挑选酶,随后在挑选:目录中挑选酶组名字。
2、按名字挑选酶
要在选定酶组里开展检索,请在输入框中键入酶名字。
或是,点击酶名字以挑选它。
3、加上到酶组
要将选中的酶加上到Chosen Enzymes设定,请单击Add→按键。
要将初始集中化的全部酶加上到Chosen Enzymes集,请单击Add All→按键。
4、从酶套服中取下
要从Chosen Enzymes设定中删掉选中的酶,请单击“ 删掉”按键或按Delete键。
要从Chosen Enzymes设定中移除全部酶,请单击Remove All按键。
5、按规范挑选酶
要依据规范挑选酶,请单击“ 挑选”勾选框。合乎选定标准的酶将在“ 挑选自:”目录中突显
要特定从这当中挑选酶的酶组,请单击“从菜单中选择”按键。
来特定由在其中所挑选的酶将降低界定的酶结合,点击酶激光切割菜单栏按键。
要特定剪截网站的总数,请在所选区中输入一个数据。假如以前未找到,则可以在右边特定剪截网站地区。
要特定酶垂悬种类设定的酶,请单击“ 垂悬”菜单栏按键。
要特定鉴别编码序列长短,请单击“ 鉴别编码序列”菜单栏按键。
要仅特定具备回文,无间断或者非简并鉴别编码序列的酶,请单击相对应的框。
snapgene精简版破译表明:
1,双击鼠标SnapGene .exe,安装程序
2,程序安装完毕后,立即更换SnapGene.exe
默认设置途径C:\Program Files (x86)\SnapGene
3,安裝破译进行,Enjoy
基本信息不用理睬,具体是已破解